高效液相色谱流动相过滤效果不好可能是由于以下原因之一：

1. 过滤器选择不当：选择的过滤器孔径过大或过小，都会影响过滤效果。如果过滤器孔径过大，流动相中的颗粒和细菌可能无法被完全过滤掉，从而影响液相色谱的分析结果。如果过滤器孔径过小，流动相的流动速度可能会受到影响，从而影响液相色谱的分析速度。

2. 过滤器使用不当：在使用过滤器时，需要按照正确的方法进行安装和使用。如果过滤器安装不正确，或者使用过程中出现破损或堵塞，都会影响过滤效果。

3. 流动相质量不佳：流动相中含有颗粒、细菌或其他污染物，也会影响过滤效果。如果流动相质量不佳，即使使用了正确的过滤器，也可能无法完全过滤掉污染物。

4. 流动相温度过高：流动相的温度过高也会影响过滤效果。过高的温度可能会导致过滤器的过滤膜变形或损坏，从而影响过滤效果。

为了提高高效液相色谱流动相的过滤效果，可以采取以下措施：

1. 选择合适的过滤器：根据流动相的性质和分析物的要求，选择合适的过滤器。通常建议选择孔径为 0.2 μm 或更小的过滤器。

2. 正确使用过滤器：在使用过滤器时，需要按照正确的方法进行安装和使用。

3. 确保流动相质量：在使用流动相之前，需要对流动相进行过滤和脱气处理，以确保流动相的质量。

4. 控制流动相温度：在使用流动相时，需要控制流动相的温度，以避免温度过高对过滤效果的影响。

需要注意的是，高效液相色谱流动相的过滤效果是保证液相色谱分析结果准确性和可靠性的重要因素之一。如果过滤效果不好，可能会导致液相色谱的分析结果出现偏差或不准确，因此需要重视流动相的过滤效果。